RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519552.1

DCTN4-208, Transcript of dynactin subunit 4, human

TSL 4

Gene DCTN4, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN4-208	ENST00000519552	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	LY6G6D	O95868	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	IGLL1	P15814	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	SERPINA2	P20848	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	VDAC1	P21796	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ZBTB25	P24278	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CD80	P33681	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	OR3A4P	P47883	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RGS4	P49798	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CUL1	Q13616	776 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	SELPLG	Q14242	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RIT2	Q99578	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552		G3V4G9	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	TBX19	O60806	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	P2RY4	P51582	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	PDK4	Q16654	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CHD4	Q14839	1912 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552		B4DXG7	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	MSH4	O15457	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CYP2B6	P20813	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	GCK	P35557	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	EFNA3	P52797	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	DIO3	P55073	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	RPA2	P15927	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF19	P17023	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	PSMA5	P28066	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	ADSS	P30520	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	SYPL1	Q16563	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	AANAT	Q16613	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	BTN3A3	O00478	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	HAT1	O14929	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DCTN4-208	ENST00000519552	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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