RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPIBQ01892 262 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HACD2Q6Y1H2 254 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPNS3Q6ZMD2 512 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASPGQ86U10 573 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAS2Q92819 552 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FERMT1Q9BQL6 677 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5AR2Q9P296 337 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAST4O15021 2626 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HELTA6NFD8 242 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MXE2 369 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP9AO75110 1047 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JCHAINP01591 159 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL4P05112 153 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHRNGP07510 517 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FCARP24071 287 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFSF9P41273 254 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASMTP46597 345 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE2AP49459 152 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPY4RP50391 375 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAS2R19P59542 299 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMK2DQ13557 499 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KYNUQ16719 465 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC22A16Q86VW1 577 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IFNEQ86WN2 208 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NECAP1Q8NC96 275 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACER1Q8TDN7 264 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P3H4Q92791 437 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPAN18Q96SJ8 248 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF226Q9NYT6 803 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP16Q9Y5T5 823 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HCRTR1O43613 425 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AHCYL1O43865 530 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD5LO43866 347 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUPT3HO75486 399 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GLCEO94923 617 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STARD3NLO95772 234 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV2-23P01705 113 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOAT1P35610 550 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SGSHP51688 502 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP5CP53041 499 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYBRD1Q53TN4 286 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCOTHQ58A44 107 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC38Q5VT99 294 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM104Q8NE00 496 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNNM3Q8NE01 707 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COG4Q9H9E3 785 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC40A1Q9NP59 571 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM114A2Q9NRY5 505 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPRTO14522 1441 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PP18 115 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H0YL77 283 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOCS1O15524 211 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ST8SIA3O43173 380 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL11P20809 199 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF235Q14590 738 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCP11X2Q5H9J9 407 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PVRIGQ6DKI7 326 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTRB2Q6GPI1 263 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF683Q8IZ20 524 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DTX3LQ8TDB6 740 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2A5Q96R48 311 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOK1Q99704 481 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRD5A3Q9H8P0 318 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVK-18Q9QC07 812 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCL27Q9Y4X3 112 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0G2JRQ6 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGALS9O00182 355 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNKO75909 580 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GAS8O95995 478 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPAN8P19075 237 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTAFRP25105 342 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HERV-K104P63124 156 aa-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms