RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARPC5	O15511	151 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CPM	P14384	443 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	UGT2B10	P36537	528 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KIR2DS3	Q14952	304 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PYCR3	Q53H96	274 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	BEST3	Q8N1M1	668 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	COQ10A	Q96MF6	247 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF208	O43345	1280 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FZD6	O60353	706 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SCGN	O76038	276 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	VNN2	O95498	520 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPR75	O95800	540 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TF	P02787	698 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	AMY2A	P04746	511 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GPR89B	P0CG08	455 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC19A1	P41440	591 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CTBP2	P56545	445 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK1G2	P78368	415 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ULK3	Q6PHR2	472 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PTOV1	Q86YD1	416 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NXPE2	Q96DL1	559 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ADO	Q96SZ5	270 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF2	O60811	474 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MT-ND4	P03905	459 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PROS1	P07225	676 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SSTR2	P30874	369 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RORA	P35398	523 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	XCR1	P46094	333 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC14A1	Q13336	389 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GRM7	Q14831	915 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ASB12	Q8WXK4	309 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SYT4	Q9H2B2	425 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193		A6NL46	340 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193		C9J4A7	227 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193		H0YGG7	62 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC6A	O75865	159 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLAT	P00750	562 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HEXB	P07686	556 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SFTPB	P07988	381 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GABRA5	P31644	462 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS3	P35030	304 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN12	P56749	244 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CRMP1	Q14194	572 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SFXN5	Q8TD22	340 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LYSMD1	Q96S90	227 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PKMYT1	Q99640	499 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SIAE	Q9HAT2	523 aa		7.53	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		7.53	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms