RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf105B2RV13 164 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL22Q53GT1 634 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL26Q53HC5 615 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF550Q7Z398 422 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf74Q86VG3 221 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR4C3Q8NH37 302 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4C6Q8NH72 309 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 PFN4Q8NHR9 129 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF721Q8TF20 911 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 TSLPQ969D9 159 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 LOXL4Q96JB6 756 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 UBQLN3Q9H347 655 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 HHATLQ9HCP6 504 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTBN2O15020 2390 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-209ENST00000504450 IRGMA1A4Y4 181 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 EFCAB7A8K855 629 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK2P20155 84 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-209ENST00000504450 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.93□□□□□ -0.82
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