RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MECR	Q9BV79	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MED11	Q9P086	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ARID1A	O14497	2285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CAD	P27708	2225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GLRA3	O75311	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ULK1	O75385	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	REM1	O75628	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CBR3	O75828	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	UTS2	O95399	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PLAU	P00749	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KNG1	P01042	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RAF1	P04049	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GSTA1	P08263	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CD99	P14209	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NAT1	P18440	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CRYGS	P22914	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DPP4	P27487	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FUT5	Q11128	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	EFR3A	Q14156	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TOMM20	Q15388	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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