RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A8MVJ9 347 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 I3L521 148 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSC22D2O75157 780 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR5F1O95221 314 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NDUFS1P28331 727 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GIPRP48546 466 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMIM11AP58511 58 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF91Q05481 1191 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FZD2Q14332 565 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNAPC1Q16533 368 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SHEQ5VZ18 495 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SHFQ7M4L6 423 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BMPERQ8N8U9 685 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OTULINQ96BN8 352 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2A5Q96R48 311 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BTBD2Q9BX70 525 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JPF8 293 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRQ8 180 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 H0YGG7 62 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HCRTR1O43613 425 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR4P46093 362 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GSTM5P46439 218 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MAN2A2P49641 1150 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ETV1P50549 477 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS3P57727 454 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF404Q494X3 552 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FCRL6Q6DN72 434 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM64Q6YI46 380 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MFSD4AQ8N468 514 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LRR1Q96L50 414 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A18Q96N87 628 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SNX18Q96RF0 628 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.51□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LAMA1P25391 3075 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AGRPO00253 132 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RGS5O15539 181 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 B3GALT2O43825 422 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0513O60268 411 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MPZL2O60487 215 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CYP7B1O75881 506 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CTSBP07858 339 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CD63P08962 238 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NT5EP21589 574 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NR0B2Q15466 257 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DUSP5Q16690 384 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DESI1Q6ICB0 168 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF614Q8N883 585 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR8K3Q8NH51 312 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TMEM203Q969S6 136 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NTNG2Q96CW9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C10orf90Q96M02 699 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRRC1Q96M27 445 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MCHR1Q99705 422 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.5□□□□□ -1.37
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