RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	RAB8B	Q92930	207 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ITCH	Q96J02	903 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CLCA1	A8K7I4	914 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF195	O14628	629 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	SEC14L5	O43304	696 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP7B1	O75881	506 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF708	P17019	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	BMP5	P22003	454 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ME2	P23368	584 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	IL12A	P29459	219 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ADH7	P40394	386 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	IDH3A	P50213	366 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MAVS	Q7Z434	540 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF130	Q86XS8	419 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	NEURL3	Q96EH8	262 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CUBN	O60494	3623 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM234B	A2RU67	622 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF264	O43296	627 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	SASH3	O75995	380 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CTSS	P25774	331 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	UQCRC1	P31930	480 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	OPRM1	P35372	400 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	LHX2	P50458	406 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	P2RX1	P51575	399 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CCR4	P51679	360 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CLDN18	P56856	261 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	KLHL26	Q53HC5	615 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBMS1-215	ENST00000492283	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	FCMR	O60667	390 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	LY6G6D	O95868	133 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	CSTA	P01040	98 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBMS1-215	ENST00000492283	NR2F1	P10589	423 aa		10.39	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms