RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 GPR119Q8TDV5 335 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL15Q96M94 604 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 CFLARO15519 480 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 THBDP07204 575 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ADH6P28332 368 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 HOXC12P31275 282 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 EIF1P41567 113 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SLC1A6P48664 564 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 C6orf120Q7Z4R8 191 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF527Q8NB42 609 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO27Q8NI29 283 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 OSTF1Q92882 214 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 HS3ST6Q96QI5 342 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 MED18Q9BUE0 208 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PRRG4Q9BZD6 226 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 EMC9Q9Y3B6 208 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJA2O60884 412 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 MYZAPP0CAP1 466 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PRKCAP17252 672 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 BGNP21810 368 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A53Q5H9E4 307 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 PPP4R4Q6NUP7 873 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 STAC2Q6ZMT1 411 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 OLIG3Q7RTU3 272 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 WFDC11Q8NEX6 87 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 MIPOL1Q8TD10 442 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RNF128Q8TEB7 428 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB9Q96C00 473 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ARSGQ96EG1 525 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 FCMRO60667 390 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ME2P23368 584 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 AGTR1P30556 359 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SFTPDP35247 375 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 SOAT1P35610 550 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ5P48544 419 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD34AQ69YU3 496 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 ROBO4Q8WZ75 1007 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 GLRX2Q9NS18 164 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-211ENST00000490677 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF195O14628 629 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SYNGR4O95473 234 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TUBBP07437 444 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 MATN1P21941 496 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF141Q15928 474 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TESCQ96BS2 214 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3IP1Q96FE7 263 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PLGP00747 810 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 C1QCP02747 245 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CTBP2P56545 445 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CARD18P57730 90 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R2AP63151 447 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SKP2Q13309 424 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 BHLHB9Q6PI77 547 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD46Q86W74 232 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD3Q8WU67 409 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35G5Q96KT7 338 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 MRGPRX4Q96LA9 322 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 NUF2Q9BZD4 464 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 DPY30Q9C005 99 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 MEAF6Q9HAF1 191 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PNPOQ9NVS9 261 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SERINC4A6NH21 518 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 H3BNH8 94 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF264O43296 627 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 KLF4O43474 513 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 DIAPH2O60879 1101 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 UGT2B17O75795 530 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT14O95848 222 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CASP9P55211 416 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 BST1Q10588 318 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 FUT5Q11128 374 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CASP8Q14790 479 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 OR5W2Q8NH69 310 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TEX37Q96LM6 180 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms