RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GDF9O60383 454 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LPLP06858 475 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 THBS2P35442 1172 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GGT2P36268 569 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 XKP51811 444 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ERVK-25P63136 954 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DDI2Q5TDH0 399 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC34A3Q8N130 599 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TTC16Q8NEE8 873 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ART5Q96L15 291 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 APOLD1Q96LR9 279 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD180Q99467 661 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PKP4Q99569 1192 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 COPS8Q99627 209 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 AMBNQ9NP70 447 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LUZP4Q9P127 313 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NCOR1O75376 2440 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SERTM1A2A2V5 107 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR6C74A6NCV1 312 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SGK494L7N484 410 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PPM1DO15297 605 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 VIPP01282 170 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SCG5P05408 212 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SPP1P10451 314 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SPI1P17947 270 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NDUFS1P28331 727 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD1CP29017 333 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SSTR2P30874 369 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SSTR4P31391 388 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CCR7P32248 378 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TGM4P49221 684 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LUZP2Q86TE4 346 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 Q8N402 240 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF511Q8NB15 262 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RHOVQ96L33 236 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HHATLQ9HCP6 504 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PADI2Q9Y2J8 665 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TTC28Q96AY4 2481 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 H7C2Y5 167 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC31A1O15431 190 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GABRB1P18505 474 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 STOMP27105 288 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CRYBB2P43320 205 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 GNG10P50151 68 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CAMK2DQ13557 499 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MED22Q15528 200 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD276Q5ZPR3 534 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 C10orf90Q96M02 699 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.14□□□□□ -1.27
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USP4-211ENST00000485450 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 BSNQ9UPA5 3926 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FITM1A5D6W6 292 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MARCH11A6NNE9 402 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C4orf47A7E2U8 309 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 M0R233 179 aa7.13□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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