RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	CLDN18	P56856	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	KCNC4	Q03721	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF117	Q03924	483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ART3	Q13508	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NFYC	Q13952	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GK3P	Q14409	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PDK3	Q15120	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NNAT	Q16517	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	WNT2B	Q93097	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TIMP4	Q99727	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RUBCNL	Q9H714	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A1B0GTH9	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525		B4DXG7	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NPIPB7	O75200	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MFN2	O95140	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PMS2P2	O95744	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LGI1	O95970	557 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LDLR	P01130	860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PRB1	P04280	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BCHE	P06276	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ETFA	P13804	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ABO	P16442	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	IL7R	P16871	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BMP7	P18075	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CALB2	P22676	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ME2	P23368	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PAX7	P23759	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	HTR1E	P28566	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PTGER1	P34995	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SMS	P52788	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RAC3	P60763	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR85	P60893	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PLAUR	Q03405	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CHRNE	Q04844	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MERTK	Q12866	999 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	EPS8	Q12929	822 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BNIP2	Q12982	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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