RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 CYP7B1O75881 506 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 OR5F1O95221 314 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 GADD45GO95257 159 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 SERPINA7P05543 415 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF23P17027 643 aa6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 STK32CQ86UX6 486 aa6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.44□□□□□ -1.38
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SHQ1-207ENST00000475558 CHAF1BQ13112 559 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 IL18R1Q13478 541 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 MED21Q13503 144 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 DAG1Q14118 895 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 PCOLCEQ15113 449 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 NPTX1Q15818 432 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 MEP1AQ16819 746 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 LCN10Q6JVE6 187 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-207ENST00000475558 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.44□□□□□ -1.38
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