RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	ZP3	P21754	424 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	CALB2	P22676	271 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PAX7	P23759	505 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	ADORA2B	P29275	332 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	UGT1A3	P35503	534 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PPT1	P50897	306 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	LIM2	P55344	173 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	CBX1	P83916	185 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	RAB40B	Q12829	278 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA0040	Q15053	153 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PRR4	Q16378	134 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	SYT14	Q8NB59	555 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF607	Q96SK3	696 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	RIT2	Q99578	217 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	TXN2	Q99757	166 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	NANS	Q9NR45	359 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	RNF14	Q9UBS8	474 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	PDE10A	Q9Y233	779 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	ALG6	Q9Y672	507 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CLK1-208	ENST00000464454	WWP2	O00308	870 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF254	O75437	659 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	STS	P08842	583 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	UQCRC2	P22695	453 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	HPCAL1	P37235	193 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	STAR	P49675	285 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MESD	Q14696	234 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	RNF212	Q495C1	297 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SBK1	Q52WX2	424 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	IPMK	Q8NFU5	416 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	OR2T3	Q8NH03	318 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	FAM3C	Q92520	227 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	KDR	P35968	1356 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SERF1A	O75920	110 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	LRAT	O95237	230 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	IQCF3	P0C7M6	154 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC166	P0CW27	439 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	KLK2	P20151	261 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	AZU1	P20160	251 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SPIB	Q01892	262 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms