RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINB4P48594 390 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 P2RY6Q15077 328 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF385BQ569K4 471 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CFAP157Q5JU67 520 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 AGAP6Q5VW22 663 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RELL1Q8IUW5 271 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF527Q8NB42 609 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CDS1Q92903 461 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 EGLN2Q96KS0 407 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TSSK3Q96PN8 268 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.13□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PNR3 127 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PQD3 144 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SERTM1A2A2V5 107 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF814B7Z6K7 855 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 H3BNH8 94 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 OIP5O43482 229 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RAD51DO75771 328 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CD8AP01732 235 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 IFI6P09912 130 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 LINGO3P0C6S8 592 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GGT1P19440 569 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ENPP1P22413 925 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SPOCK1Q08629 439 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SELENBP1Q13228 472 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A25Q6T423 547 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZT83 130 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 DTX2Q86UW9 622 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SLC43A2Q8N370 569 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF525Q8N782 197 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC63Q8NA47 563 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GIMAP5Q96F15 307 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CHODLQ9H9P2 273 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PR80 420 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RGS14O43566 566 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CYP7B1O75881 506 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 HSPA4LO95757 839 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3-9P01782 118 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 LCN1P31025 176 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MAP3K8P41279 467 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 OR3A2P47893 321 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FABP6P51161 128 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF83P51522 516 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 P2RX1P51575 399 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 DSCR9P59020 149 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CHRNEQ04844 493 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TP53BP2Q13625 1128 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 RAB35Q15286 201 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 GALNTL6Q49A17 601 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CDC73Q6P1J9 531 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 CBLN3Q6UW01 205 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.11□□□□□ -0.95
DDX39B-211ENST00000449757 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms