RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 APOLD1Q96LR9 279 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SIGMAR1Q99720 223 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SEC11CQ9BY50 192 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PNV4 684 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LRP5LA4QPB2 252 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2CO00762 179 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PIP5K1BO14986 540 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CTNSO60931 367 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC6AO75865 159 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-209ENST00000442510 AKR1A1P14550 325 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ASCL1P50553 236 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-209ENST00000442510 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf64Q86WR6 236 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 M1APQ8TC57 530 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGDIGQ99819 225 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SGPP1Q9BX95 441 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SFTA3P0C7M3 94 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-209ENST00000442510 CYP2F1P24903 491 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CDK2P24941 298 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GRM4Q14833 912 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HERPUD1Q15011 391 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CPTPQ5TA50 214 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRC-209ENST00000442510 NOX3Q9HBY0 568 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE10A6NGK3 116 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FZD7O75084 574 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IL3P08700 152 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PRR35P0CG20 571 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NID1P14543 1247 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CXCR1P25024 350 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLCN5P51795 746 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 JAG1P78504 1218 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DCST1Q5T197 706 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PIM3Q86V86 326 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CPXM2Q8N436 756 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRC-209ENST00000442510 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FZD10Q9ULW2 581 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087X1B8 175 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 I6L893 689 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
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