RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ART5Q96L15 291 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SPSB2Q99619 263 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 POM121BA6NF01 834 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DLL1O00548 723 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM12O43184 909 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OAZ2O95190 189 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 POMCP01189 267 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 THP07101 528 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SHC1P29353 583 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ACVRL1P37023 503 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP4Q13115 394 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAM2Q15035 370 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC157Q569K6 752 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DCST1Q5T197 706 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR18Q8N4B5 295 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ACP2P11117 423 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 THBS2P35442 1172 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A3P43003 542 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK6Q00534 326 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SYTL3Q4VX76 610 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MANEAQ5SRI9 462 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CPTPQ5TA50 214 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLBQ86Z14 1044 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP6Q8TBB0 222 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO17Q96EF6 278 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SHDQ96IW2 340 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GINS4Q9BRT9 223 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PBX4Q9BYU1 374 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GHRLQ9UBU3 117 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CBLCQ9ULV8 474 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PADI3Q9ULW8 664 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GW55 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD9O00233 223 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DKK1O94907 266 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2ABP04908 130 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A8P05109 93 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MTNR1AP48039 350 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB40BQ12829 278 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HACD4Q5VWC8 232 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf63Q68DL7 685 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SVBPQ8N300 66 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms