RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SMU1Q2TAY7 513 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CBLN3Q6UW01 205 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 GSX2Q9BZM3 304 aa18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TYROBPO43914 113 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NTN1O95631 604 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 HEXAP06865 529 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SHC1P29353 583 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SFTPDP35247 375 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 VSNL1P62760 191 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 LTBQ06643 244 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO27Q8NI29 283 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ARSGQ96EG1 525 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SMR3AQ99954 134 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP26Q9BV47 211 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL13Q9P2N7 655 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CARD8Q9Y2G2 431 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.72■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF195O14628 629 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 EFNA2O43921 213 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT14O95848 222 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 AK1P00568 194 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCAP17252 672 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 HBA1P69905 142 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 EMX2Q04743 252 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SELENBP1Q13228 472 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 EMBQ6PCB8 327 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 GPR119Q8TDV5 335 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP90Q8TF47 636 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD3Q8WU67 409 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 OR7D2Q96RA2 312 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 HDHD5Q9BXW7 423 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 KCNE3Q9Y6H6 103 aa18.71■□□□□ 0.59
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 DUXAA6NLW8 204 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPA7E9PJI5 369 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 OIP5O43482 229 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPA8P0DM63 369 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 G6PDP11413 515 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN8P56748 225 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM201Q5SNT2 666 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 SLC43A2Q8N370 569 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 SDF2Q99470 211 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 BDH2Q9BUT1 245 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf49Q9H741 205 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 COQ10BQ9H8M1 238 aa18.7■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 DSCAMO60469 2012 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 NAV3Q8IVL0 2385 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 CFLARO15519 480 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF264O43296 627 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJA2O60884 412 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 PRKD3O94806 890 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 UBL4AP11441 157 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 CREB1P16220 341 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 CBFBQ13951 182 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 FCRLAQ7L513 359 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 OR5W2Q8NH69 310 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT8Q8WV74 236 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 PERPQ96FX8 193 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 Q96MF0 132 aa18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.68■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 ESPNB1AK53 854 aa18.68■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 GUSBP08236 651 aa18.68■□□□□ 0.58
LIMS1-208ENST00000428064 PTH2RP49190 550 aa18.68■□□□□ 0.58
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