RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO27Q8NI29 283 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MZB1Q8WU39 189 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRL1Q96LA6 429 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSSK3Q96PN8 268 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG2Q9H553 416 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf109Q9NX04 203 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa11.69□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPRXA6NFQ7 191 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC28A1O00337 649 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF195O14628 629 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIPK2O43353 540 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS14O43566 566 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKAP10O43572 662 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFNA2O43921 213 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLRA3O75311 464 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT14O95848 222 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FESP07332 822 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YES1P07947 543 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP157Q5JU67 520 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLN3Q6UW01 205 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTX2Q86UW9 622 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP90Q8TF47 636 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STACQ99469 402 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD2Q9BX70 525 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CADP27708 2225 aa11.68□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OIP5O43482 229 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD8AP01732 235 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROCP04070 461 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEFHP12036 1026 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX1P51575 399 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH11P55287 796 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB13P59910 316 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENBP1Q13228 472 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK11Q15831 433 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZT83 130 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC43A2Q8N370 569 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MNS1Q8NEH6 495 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T11Q8NH01 316 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDS1Q92903 461 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSD2Q9BQI7 771 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf36Q9H7Y0 433 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCO1Q9HAY6 547 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIN1Q9NXP7 522 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBK1Q9UHD2 729 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.67□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MV72 311 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHISA9B4DS77 424 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA7E9PJI5 369 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAMP1O60894 148 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYZL6O75951 148 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA8P0DM63 369 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCAP17252 672 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1C1P21283 382 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENPP1P22413 925 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A1P30825 629 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR3A2P47893 321 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C21orf58P58505 322 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPA1Q15181 289 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRF1Q16656 503 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZSR9 355 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms