RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 MYOGP15173 224 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CNIH2Q6PI25 160 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf72A4D263 438 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TVP23AA6NH52 213 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HRGP04196 525 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXK1P85037 733 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP90Q8TF47 636 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 P2RY12Q9H244 342 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OBP2AQ9NY56 170 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DIRAS3O95661 229 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 AMY2AP04746 511 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS6P49758 472 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SPTSSAQ969W0 71 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP50Q9UKX7 468 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PFN3P60673 137 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf183Q5T699 404 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMB10P40306 273 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR3AP46098 478 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GNMTQ14749 295 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PELI3Q8N2H9 469 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GGHQ92820 318 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LYRM1O43325 122 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP24386 653 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PTH2RP49190 550 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF7P61962 342 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ARSKQ6UWY0 536 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LCATP04180 440 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS3P35030 304 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LILRA2Q8N149 483 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 STOML3Q8TAV4 291 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ICKQ9UPZ9 632 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV3-25P01717 112 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 NPPBP16860 134 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A5P22732 501 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BEST3Q8N1M1 668 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A5Q9Y345 797 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DRD5P21918 477 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PBX2P40425 430 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN31Q12999 210 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R036 132 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNK5O95279 499 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TSC22D1Q15714 1073 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRED1Q7Z699 444 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 COQ8AQ8NI60 647 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CD93Q9NPY3 652 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFAND5O76080 213 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF91Q05481 1191 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 C18orf63Q68DL7 685 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 PLPP6Q8IY26 295 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-CQ95604 372 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 NXPE3Q969Y0 559 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 AGAP5A6NIR3 686 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL6IP1Q15041 203 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF77Q15935 545 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms