RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 A0A0J9YY10 115 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 MEIOCA2RUB1 952 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SOCS6O14544 535 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 HOXD12P35452 270 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 FXYD6P3P58550 94 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 AMZ1Q400G9 498 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PYDC2Q56P42 97 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 VASNQ6EMK4 673 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JNG1 304 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 H0Y8X5 98 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 FGF17O60258 216 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 COQ9O75208 318 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC2A10O95528 541 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 IFI30P13284 250 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 RBM34P42696 430 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GALEQ14376 348 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KIR2DS5Q14953 304 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CCNJQ5T5M9 372 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TP53INP1Q96A56 240 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CLDN23Q96B33 292 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LRFN5Q96NI6 719 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 PHOX2BQ99453 314 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 DPH1Q9BZG8 443 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 HAO2Q9NYQ3 351 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 KCNE5Q9UJ90 142 aa22.02■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RNF13O43567 381 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB6O75190 326 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC35E2P0CK97 266 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PRG2P13727 222 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MAKP20794 623 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 NT5EP21589 574 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 F8A1P23610 371 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R43P59537 309 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CA13Q8N1Q1 262 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TMED9Q9BVK6 235 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RAB38P57729 211 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PLBD1Q6P4A8 553 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TMEM91Q6ZNR0 172 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 OR10G6Q8NH81 332 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 HDHD5Q9BXW7 423 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RERGLQ9H628 205 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TRIM36Q9NQ86 728 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CPNE7Q9UBL6 633 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MMP17Q9ULZ9 603 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 VPS13AQ96RL7 3174 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 C12orf71A8MTZ7 269 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CHP2O43745 196 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PTP4A3O75365 173 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TNFP01375 233 aa22■■□□□ 1.11
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PMS1-205ENST00000409985 ATAD3CQ5T2N8 411 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 MZT2BQ6NZ67 158 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CNIH2Q6PI25 160 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 C11orf74Q86VG3 221 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 KLBQ86Z14 1044 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ZFP41Q8N8Y5 198 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 DUSP18Q8NEJ0 188 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 OR51G2Q8NGK0 314 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ZNF426Q9BUY5 554 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 ALG8Q9BVK2 526 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 COMMD3Q9UBI1 195 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 CA5BQ9Y2D0 317 aa22■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 LRP4O75096 1905 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 B4DXG7 233 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G10O15496 165 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DMAP28067 261 aa21.99■■□□□ 1.11
PMS1-205ENST00000409985 RABIFP47224 123 aa21.99■■□□□ 1.11
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