RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 HOXC5Q00444 222 aa23.47■■□□□ 1.35
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SPIRE1-202ENST00000409402 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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SPIRE1-202ENST00000409402 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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SPIRE1-202ENST00000409402 EMCNQ9ULC0 261 aa23.44■■□□□ 1.34
SPIRE1-202ENST00000409402 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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