RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 VEZF1Q14119 521 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TP53I3Q53FA7 332 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MPP7Q5T2T1 576 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC14AQ86T13 490 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CADM3Q8N126 398 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GCM1Q9NP62 436 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RASD1Q9Y272 281 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0A6YYH2 397 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A6NJ64 397 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT8O14734 319 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TXNL1O43396 289 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 DDCP20711 480 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF33BQ06732 778 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TCTE1Q5JU00 501 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAET1LQ5VY80 246 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF225Q9UK10 706 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NHSQ6T4R5 1651 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RREB1Q92766 1687 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GTW7 788 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A6NIZ1 184 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN24A6NM45 220 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 F5H5P2 479 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TSTD3H0UI37 97 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GMDSO60547 372 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ICMTO60725 284 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS4O75173 837 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ACRP10323 421 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF43P17038 809 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAP1BP61224 184 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 LSMEM2Q8N112 164 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LPAR4Q99677 370 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TLR9Q9NR96 1032 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ARGFXA6NJG6 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CD300LBA8K4G0 201 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SEC14L2O76054 403 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 CD63P08962 238 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CAV2P51636 162 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CPZQ66K79 652 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SPRED1Q7Z699 444 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LAX1Q8IWV1 398 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR7G3Q8NG95 312 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FBRSQ9HAH7 460 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NPC1O15118 1278 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GPR39O43194 453 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SCO2O43819 266 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC10A3P09131 477 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ITGAMP11215 1152 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CRABP1P29762 137 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GCH1P30793 250 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CX3CR1P49238 355 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GRM7Q14831 915 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PEA15Q15121 130 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DUSP7Q16829 419 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR1S1Q8NH92 325 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DDIT4LQ96D03 193 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CUTCQ9NTM9 273 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 IL17CQ9P0M4 197 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAD1O60671 282 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PROS1P07225 676 aa8.34□□□□□ -1.07
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