RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 SPRY4Q9C004 299 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 PCNX2A6NKB5 2137 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 OIP5O43482 229 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 PPM1BO75688 479 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 RAB40ALP0C0E4 278 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 IDH2P48735 452 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 COPZ1P61923 177 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 WDR88Q6ZMY6 472 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 PHOX2BQ99453 314 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 GPA33Q99795 319 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 SELENONQ9NZV5 590 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 CNIH4Q9P003 139 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 CARD8Q9Y2G2 431 aa27.01■■□□□ 1.92
LMO2-202ENST00000395833 OR6C70A6NIJ9 312 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ZNF264O43296 627 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CHP2O43745 196 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 NGFRP08138 427 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 OMPP47874 163 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CDH15P55291 814 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RPS18P62269 152 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CDK5R2Q13319 367 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EFR3AQ14156 821 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EXT1Q16394 746 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ESX1Q8N693 406 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 LSMEM1Q8N8F7 131 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 FBLIM1Q8WUP2 373 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TMEM239Q8WW34 195 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TCFL5Q9UL49 500 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TMEM200CA6NKL6 621 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TNFSF15O95150 251 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 LINGO3P0C6S8 592 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 SKP2Q13309 424 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ALG10BQ5I7T1 473 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TMEM236Q5W0B7 351 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 KIRREL2Q6UWL6 708 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 MARCH3Q86UD3 253 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 DEPDC4Q8N2C3 294 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 POGLUT1Q8NBL1 392 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RASSF1Q9NS23 344 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PQD3 144 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ZAR1LA6NP61 321 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 GPR4P46093 362 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TSPAN31Q12999 210 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 APOFQ13790 326 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 OR5M3Q8NGP4 307 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ELP5Q8TE02 316 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 IMPAD1Q9NX62 359 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 AASSQ9UDR5 926 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RNF6Q9Y252 685 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ALG1L2C9J202 215 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 NDUFB5O43674 189 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 SCO2O43819 266 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 NADKO95544 446 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ANGPTL1O95841 491 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CLPTM1O96005 669 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 OTX2P32243 289 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EVI2BP34910 448 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RPS15P62841 145 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ENTHD1Q8IYW4 607 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 UBE2FQ969M7 185 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 IMMP1LQ96LU5 166 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 LAT2Q9GZY6 243 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 MYOTQ9UBF9 498 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 SOCS6O14544 535 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 DKK1O94907 266 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 TP53P04637 393 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 FPR3P25089 353 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 FBXW4P57775 412 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CDC42P60953 191 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 ULK3Q6PHR2 472 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 OR11G2Q8NGC1 345 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 PFN4Q8NHR9 129 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 SLC22A8Q8TCC7 542 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 MPP4Q96JB8 637 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 HS6ST2Q96MM7 605 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 MED31Q9Y3C7 131 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 DPPA5A6NC42 116 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CELA2AP08217 269 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 FMO3P31513 532 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 LAIR2Q6ISS4 152 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 CBLN3Q6UW01 205 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 NDUFAF7Q7L592 441 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO2-202ENST00000395833 RTN4RQ9BZR6 473 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms