RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.4■□□□□ 0.06
USP11-202ENST00000377078 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP11-202ENST00000377078 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 HDAC3O15379 428 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF264O43296 627 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CXCL13O43927 109 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 AQP8O94778 261 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SFTPDP35247 375 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 KHKP50053 298 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CARD18P57730 90 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 HPCAP84074 193 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 FOXF1Q12946 379 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 STK32CQ86UX6 486 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OR5W2Q8NH69 310 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ADGRG7Q96K78 797 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 AKAP6Q13023 2319 aa15.39■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SERINC4A6NH21 518 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 C16orf97H3BN30 126 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ANKRD28O15084 1053 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OPN1LWP04000 364 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 UGT2B10P36537 528 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 FAM27E3Q08E93 113 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 KEAP1Q14145 624 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CASP8Q14790 479 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CBLN3Q6UW01 205 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CLEC4FQ8N1N0 589 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 FBXO27Q8NI29 283 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 POC1BQ8TC44 478 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OSTF1Q92882 214 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OR51I1Q9H343 314 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 POLE3Q9NRF9 147 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 AIG1Q9NVV5 245 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 BTNL2Q9UIR0 455 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.38■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 HIVEP1P15822 2718 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 A0A0J9YW62 118 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF195O14628 629 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CYP7B1O75881 506 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CSTAP01040 98 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CGAP01215 116 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 RAF1P04049 648 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 HRGP04196 525 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 GUSBP08236 651 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SLC7A1P30825 629 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SLC6A8P48029 635 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SELENBP1Q13228 472 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 GUSBP1Q15486 140 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF141Q15928 474 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 NXNQ6DKJ4 435 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 GPR119Q8TDV5 335 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 TMEM234Q8WY98 164 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ARSGQ96EG1 525 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 NEURL3Q96EH8 262 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PANX1Q96RD7 426 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 MKLN1Q9UL63 735 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 WDR45Q9Y484 360 aa15.37■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 ABCA4P78363 2273 aa15.36■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SDHDO14521 159 aa15.36■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 SCN2BO60939 215 aa15.36■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 PGRP06401 933 aa15.36■□□□□ 0.05
USP11-202ENST00000377078 OR12D1P0DN82 309 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms