RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 AP3S1Q92572 193 aa21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TIMP4Q99727 224 aa21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 IFT27Q9BW83 186 aa21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.46■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 B4DXG7 233 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HLA-DPB1P04440 258 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 LBX1P52954 281 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 KIAA1024LP59773 190 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ABHD13Q7L211 337 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PTP4A1Q93096 173 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ALG8Q9BVK2 526 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ISYNA1Q9NPH2 558 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CDHR4A6H8M9 788 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 TYRP1P17643 537 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ASAH1Q13510 395 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 NIPAL3Q6P499 406 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 RPTNQ6XPR3 784 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 OR4N2Q8NGD1 307 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HS6ST2Q96MM7 605 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.45■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 BHLHE40O14503 412 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 NID1P14543 1247 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 BMP7P18075 431 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 BPIFA2Q96DR5 249 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 NOTOA8MTQ0 251 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 IDH3BO43837 385 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 AGR2O95994 175 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HMGN1P05114 100 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CHRNB1P11230 501 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CHAC2Q8WUX2 184 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 IL21RQ9HBE5 538 aa21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 LYPD3O95274 346 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 IL9P15248 144 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 EIPR1Q53HC9 387 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 IDNKQ5T6J7 187 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ARL9Q6T311 187 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 Q6ZSR6 202 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ACBD7Q8N6N7 88 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CYR61O00622 381 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 TNFSF14O43557 240 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 RDH16O75452 317 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 DBIP07108 87 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 TPMTP51580 245 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HCCSP53701 268 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 NNATQ16517 81 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GHDCQ8N2G8 530 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PLSCR3Q9NRY6 295 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MED17Q9NVC6 651 aa21.43■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 DAPL1A0PJW8 107 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 URADA6NGE7 173 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 J3QRE1 110 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 HRKO00198 91 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 RNF13O43567 381 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PSKH1P11801 424 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MYL9P24844 172 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 E2F1Q01094 437 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CD83Q01151 205 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 FOXK2Q01167 660 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 C1orf61Q13536 156 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ZFP69Q49AA0 526 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 OR13H1Q8NG92 308 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 ENKURQ8TC29 256 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 FAM60AQ9NP50 221 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 CHST10O43529 356 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 GPR75O95800 540 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 SHC1P29353 583 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 PPP3R1P63098 170 aa21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GALNT12-201ENST00000375011 SLC3A1Q07837 685 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms