RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINE2P07093 398 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CT62P0C5K7 136 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRPS2P11908 318 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UNGP13051 313 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B4GALT1P15291 398 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN8P19075 237 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GSTM2P28161 218 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MPLP40238 635 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BTDP43251 543 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PSMB2P49721 201 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 E2F1Q01094 437 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG1Q06432 222 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FOXL1Q12952 345 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GRIK2Q13002 908 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NADSYN1Q6IA69 706 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM40Q6P9F5 258 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DAW1Q8N136 415 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IL1F10Q8WWZ1 152 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TAAR8Q969N4 342 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ULK4Q96C45 1275 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AP2M1Q96CW1 435 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OLFM3Q96PB7 478 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNA7Q96RP8 456 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACTL8Q9H568 366 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OSER1Q9NX31 292 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARMCX1Q9P291 453 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PALLDQ8WX93 1383 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.28□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ABCB11O95342 1321 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0D9SFI3 127 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM49D1C9J1S8 452 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IMPA2O14732 288 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 INPP4BO15327 924 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GRID2O43424 1007 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DENRO43583 198 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UMODP07911 640 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD63P08962 238 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2D6P10635 497 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PGAM2P15259 253 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PRDX2P32119 198 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD79BP40259 229 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ETV6P41212 452 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PPP3CCP48454 512 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MTCP1P56278 107 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PLP2Q04941 152 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNB3Q05901 458 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRAF3Q13114 568 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ITIH4Q14624 930 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GINS1Q14691 196 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MEF2DQ14814 521 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NRF1Q16656 503 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP69Q49AA0 526 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf52Q5T4I8 152 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2UQ5VVX9 321 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC24Q6P3W2 148 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF600Q6ZNG1 722 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RHOUQ7L0Q8 258 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DSELQ8IZU8 1212 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 Q8N402 240 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GATSQ8NAP1 163 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms