RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLLPQ9Y342 182 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTPRUQ92729 1446 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF407Q9C0G0 2248 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HELTA6NFD8 242 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 H7C0S8 307 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AKAP3O75969 853 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC35G4P0C7Q5 338 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHTF8P0CG12 524 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GLULP15104 373 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NMUP48645 174 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PITPNBP48739 271 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCL11P51671 97 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC10A7Q0GE19 358 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGFBP7Q16270 282 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PARP6Q2NL67 630 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATF7IP2Q5U623 682 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C1orf146Q5VVC0 180 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NCR3LG1Q68D85 454 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC39A4Q6P5W5 647 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 P4HA3Q7Z4N8 544 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AMZ2Q86W34 360 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PCP2Q8IVA1 136 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NAT8LQ8N9F0 302 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NKAPP1Q8N9T2 125 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NDFIP1Q9BT67 221 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CACNG6Q9BXT2 260 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ABCG4Q9H172 646 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IFI27L2Q9H2X8 130 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COG4Q9H9E3 785 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SOHLH2Q9NX45 425 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GHRLQ9UBU3 117 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRAPPC4Q9Y296 219 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MSH4O15457 936 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ENTPD5O75356 428 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ICAM2P13598 275 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VCLP18206 1134 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KIR3DL2P43630 455 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CASP9P55211 416 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SNU13P55769 128 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TAS2R19P59542 299 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASIC1P78348 528 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TSPY1Q01534 308 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NUCB1Q02818 461 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ENPEPQ07075 957 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C17orf67Q0P5P2 114 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NME3Q13232 169 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRB7Q14451 532 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UBE2SQ16763 222 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MEP1BQ16820 701 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IL23RQ5VWK5 629 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LIPKQ5VXJ0 399 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR8G2PQ6IF36 304 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF562Q6V9R5 426 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF621Q6ZSS3 439 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM47EQ6ZV65 393 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRSS42Q7Z5A4 293 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NRMQ8IXM6 262 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NPBQ8NG41 125 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC5A11Q8WWX8 675 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC51Q96ER9 411 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL21A1Q96P44 957 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FOXC2Q99958 501 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRPV6Q9H1D0 765 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CALHM2Q9HA72 323 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COPS7AQ9UBW8 275 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NRBP1Q9UHY1 535 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PDS5BQ9NTI5 1447 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MYO16Q9Y6X6 1858 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A0G2JRQ6 117 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF878C9JN71 531 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RRP8O43159 456 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 P04436 131 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CXCL5P42830 114 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAGEA4P43358 317 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCZ1BP86790 482 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP2R5CQ13362 524 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms