RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LUZP2Q86TE4 346 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GGNQ86UU5 652 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF527Q8NB42 609 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM222BQ8WU58 562 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ITCHQ96J02 903 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC115Q96NT0 180 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR7D2Q96RA2 312 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR52B2Q96RD2 323 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PINK1Q9BXM7 581 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PIGMQ9H3S5 423 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NPHS2Q9NP85 383 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MED17Q9NVC6 651 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT8Q9NY28 637 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 STOML1Q9UBI4 398 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF175Q9Y473 711 aa6.9□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZFHX3Q15911 3703 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 A6NNC1 897 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 H3BNH8 94 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A2O15244 555 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF21O75509 655 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CTAG2O75638 210 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF13O75888 250 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KRT75O95678 551 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT14O95848 222 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA8P0DM63 369 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 UQCRC2P22695 453 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ME2P23368 584 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ARFIP2P53365 341 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PON3Q15166 354 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MAPRE2Q15555 327 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 VWA1Q6PCB0 445 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MAVSQ7Z434 540 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD46Q86W74 232 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF614Q8N883 585 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TSPEARQ8WU66 669 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FIG4Q92562 907 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NRGNQ92686 78 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RNF145Q96MT1 663 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E6Q96RD3 313 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 PANX1Q96RD7 426 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPAS1Q99742 590 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RNF122Q9H9V4 155 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 EXD2Q9NVH0 621 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA4P78363 2273 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM247A6NEH6 219 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC154A6NI56 674 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 RFXANKO14593 260 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-201ENST00000361543 MSTNO14793 375 aa6.88□□□□□ -1.31
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