RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 APBB3O95704 486 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 YES1P07947 543 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CTSEP14091 401 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 APEX1P27695 318 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 GCGRP47871 477 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CNIH2Q6PI25 160 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 USP53Q70EK8 1073 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR10Q9NZ32 417 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 POLHQ9Y253 713 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 HPGDSO60760 199 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TDGQ13569 410 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 INSL4Q14641 139 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 EIPR1Q53HC9 387 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SIRT6Q8N6T7 355 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPN10Q9HC96 672 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DAPP1Q9UN19 280 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM183AA6NL82 134 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP8BP34820 402 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FXYD6P3P58550 94 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK14Q16539 360 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNJQ5T5M9 372 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FCRL6Q6DN72 434 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A18Q96BI1 424 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF350Q9GZX5 532 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TWSG1Q9GZX9 223 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGUQ9H490 435 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 IL21RQ9HBE5 538 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PLSCR3Q9NRY6 295 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFSF14O43557 240 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PRG2P13727 222 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GALP22466 123 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1E1P36543 226 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 EVX1P49640 407 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MADCAM1Q13477 382 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 QPRTQ15274 297 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR68Q15743 365 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FHL5Q5TD97 284 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM91Q6ZNR0 172 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KLBQ86Z14 1044 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2J2Q8N2K1 259 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ENKURQ8TC29 256 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LDB3O75112 727 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NCR1O76036 304 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 CPMP14384 443 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR2AP28223 471 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 COL19A1Q14993 1142 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FIGLAQ6QHK4 219 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR88Q6ZMY6 472 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP18Q8NEJ0 188 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52D1Q9H346 318 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SLA2Q9H6Q3 261 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPV5Q9NQA5 729 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 UNC119BA6NIH7 251 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFP01375 233 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MYF5P13349 255 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DS3Q14952 304 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 GID4Q8IVV7 300 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N402 240 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMP4Q99727 224 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 DPH1Q9BZG8 443 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF32Q9H0A6 362 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ENKD1Q9H0I2 346 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM60AQ9NP50 221 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms