RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 GABARAPO95166 117 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 PTHP01270 115 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NR4A1P22736 598 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MLLT10P55197 1068 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 DCAF7P61962 342 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NFATC3Q12968 1075 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 AQP6Q13520 282 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 PGGHGQ32M88 737 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CADM2Q8N3J6 435 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CRELD1Q96HD1 420 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LRR1Q96L50 414 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SAMD8Q96LT4 415 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 EFCAB7A8K855 629 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 UTS2O95399 124 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 FUT1P19526 365 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 TGFBR2P37173 567 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 PRR22Q8IZ63 422 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 GATSQ8NAP1 163 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF527Q8NB42 609 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 FANK1Q8TC84 345 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 D6RAR5 112 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 M0R082 166 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CTBP2P56545 445 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CTF1Q16619 201 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 TIGD6Q17RP2 521 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CDK20Q8IZL9 346 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 TEX12Q9BXU0 123 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 APMAPQ9HDC9 416 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OR6C76A6NM76 312 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SCDO00767 359 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SURF4O15260 269 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 OIP5O43482 229 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 RFPL3O75679 317 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CH25HO95992 272 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HEXBP07686 556 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HBQ1P09105 142 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HPGDP15428 266 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CD36P16671 472 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 LIPAP38571 399 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SPCS2Q15005 226 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 CD226Q15762 336 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ULK3Q6PHR2 472 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 HSDL2Q6YN16 418 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.44□□□□□ -0.58
ZNF548-201ENST00000336128 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 261 ms