RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC15Q96J42 360 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PRRC1Q96M27 445 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MMP28Q9H239 520 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A9P82251 487 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PIGCQ92535 297 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SORT1Q99523 831 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 F10P00742 488 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf30Q96M34 536 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 A6NIN4 97 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 FAM183AA6NL82 134 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 RFXAPO00287 272 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 BMP2P12643 396 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 GJA4P35212 333 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 AHRP35869 848 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PRLHRP49683 370 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-CQ95604 372 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ARGFXA6NJG6 315 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF136P52737 540 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 RAB3DO95716 219 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CPMP14384 443 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CHFRQ96EP1 664 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD2Q9BX70 525 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 APMAPQ9HDC9 416 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MYH7P12883 1935 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 WASH4PA8MWX3 477 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ARRDC3Q96B67 414 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D20Q96BZ9 403 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TREX1Q9NSU2 369 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SPDEFO95238 335 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 OR51E2Q9H255 320 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MYH6P13533 1939 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SCRG1O75711 98 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SPOCK1Q08629 439 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 NFATC3Q12968 1075 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SYPL1Q16563 259 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 LTC4SQ16873 150 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 DVL2O14641 736 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINE2P07093 398 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 LHX3Q9UBR4 397 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 LYRM1O43325 122 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 GPR139Q6DWJ6 353 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CCL26Q9Y258 94 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A5O76082 557 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 F13BP05160 661 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 AOAHP28039 575 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HTR2BP41595 481 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 HTR3AP46098 478 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PPP5CP53041 499 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MEGF11A6BM72 1044 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T1O43869 369 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ZFAND5O76080 213 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 NTMT1Q9BV86 223 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 MMP2P08253 660 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 PROX2Q3B8N5 592 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 GPR149Q86SP6 731 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf15Q8WYQ4 148 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms