RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TMEM163Q8TC26 289 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 TRIM2Q9C040 744 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 RARRES3Q9UL19 164 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CHP2O43745 196 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 RFPL3O75679 317 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SCRG1O75711 98 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 HOXD12P35452 270 aa16.46■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 TIGD6Q17RP2 521 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PHF19Q5T6S3 580 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 DESI1Q6ICB0 168 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLC23A3Q6PIS1 610 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 CMIPQ8IY22 773 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 OR14A16Q8NHC5 309 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.46■□□□□ 0.23
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ACTB-201ENST00000331789 CFL2Q9Y281 166 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 MED31Q9Y3C7 131 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-201ENST00000331789 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.45■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 FRG2CA6NGY1 282 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 CD36P16671 472 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 LSMEM1Q8N8F7 131 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CRELD1Q96HD1 420 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 SLC38A2Q96QD8 506 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 APMAPQ9HDC9 416 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 OIP5O43482 229 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 UTS2O95399 124 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 FXYD6P3P58550 94 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 DOC2BQ14184 412 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 NCF4Q15080 339 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 HSDL2Q6YN16 418 aa16.45■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 SLC35B4Q969S0 331 aa16.45■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 OR5M11Q96RB7 305 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 GNB5O14775 395 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 SURF4O15260 269 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 NGFRP08138 427 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CD226Q15762 336 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 APOOLQ6UXV4 268 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CDK20Q8IZL9 346 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 OR1N1Q8NGS0 311 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 ART5Q96L15 291 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ADOQ96SZ5 270 aa16.44■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 OR52D1Q9H346 318 aa16.44■□□□□ 0.22
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ACTB-201ENST00000331789 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB7A8K855 629 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 REM1O75628 298 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 SLC2A10O95528 541 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 BCL10O95999 233 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 CTBP2P56545 445 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 VBP1P61758 197 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 FNDC7Q5VTL7 733 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-201ENST00000331789 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.43■□□□□ 0.22
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