RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DSN1Q9H410 356 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEN1O00255 615 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTS2O95399 124 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBXA2RP21731 343 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACVR2AP27037 513 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCSK6P29122 969 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDT6P53370 316 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MC2RQ01718 297 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR107Q5VW38 600 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPSB2Q99619 263 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.11■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEATR5AQ86XA9 2040 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCDO00767 359 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC42EP2O14613 210 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC15A1P46059 708 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ULK3Q6PHR2 472 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC00114Q6XXX2 140 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RORBQ92753 470 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGF11Q92914 225 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRFN5Q96NI6 719 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMBNQ9NP70 447 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR83Q9NYM4 423 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MED31Q9Y3C7 131 aa20.1■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC28Q96AY4 2481 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN2O60636 221 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INMTO95050 263 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NGFRP08138 427 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HPGDP15428 266 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMP2P54851 167 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMBIM6P55061 237 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GP2P55259 537 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXL2P58012 376 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC34A3Q8N130 599 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRHL3Q8TE85 626 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FCGR1BQ92637 280 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTRCQ99895 268 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR54Q9H977 334 aa20.09■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKYO43930 277 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENTPD6O75354 484 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCKBRP32239 447 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP2K4P45985 399 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIRREL2Q6UWL6 708 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFN4Q8NHR9 129 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TP53INP1Q96A56 240 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.08■□□□□ 0.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC119BA6NIH7 251 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBL4AP11441 157 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFI30P13284 250 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL12BP29460 328 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKP2Q13309 424 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD226Q15762 336 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM205Q6UW68 189 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK20Q8IZL9 346 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.08■□□□□ 0.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARSGQ96EG1 525 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms