RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 DVL2O14641 736 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NPC1O15118 1278 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPNS1P04632 268 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 IL2RGP31785 369 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RRADP55042 308 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RPE65Q16518 533 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BATFQ16520 125 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC22A25Q6T423 547 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MED20Q9H944 212 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.14□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 Q7L0L9 218 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 STK35Q8TDR2 534 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 C8orf44Q96CB5 159 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 H7C1Q1 480 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC22A1O15245 554 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 IKZF1Q13422 519 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 XKR5Q6UX68 686 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GAB3Q8WWW8 586 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GNG13Q9P2W3 67 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR160Q9UJ42 338 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 J3KTA2 159 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF254O75437 659 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RP2O75695 350 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CD34P28906 385 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ART1P52961 327 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINE2P07093 398 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 UCHL1P09936 223 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXA1P55317 472 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HBMQ6B0K9 141 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR149Q86SP6 731 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MISPQ8IVT2 679 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N402 240 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BTBD17A6NE02 478 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 RHCEP18577 417 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CHMP24386 653 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 SSTR4P31391 388 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TM4SF4P48230 202 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTA2P62736 377 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTG2P63267 376 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 BMFQ96LC9 184 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HSPB11Q9Y547 144 aa11.13□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0G2JMP0 313 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 HEXAP06865 529 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 DCTP40126 519 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CXCR4P61073 352 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX3-2P78367 333 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR50Q13585 617 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 COX15Q7KZN9 410 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TLCD1Q96CP7 247 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC01553A4QN01 128 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TAZQ16635 292 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CLEC14AQ86T13 490 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 TCHHQ07283 1943 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 UNCXA6NJT0 531 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CD300LBA8K4G0 201 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 C1SP09871 688 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CNR2P34972 360 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 CPOQ8IVL8 374 aa11.12□□□□□ -0.63
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC15Q8TF66 581 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms