RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 LHX8Q68G74 356 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SLC15A4Q8N697 577 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GGT3PA6NGU5 568 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 H3BML4 177 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 IL7P13232 177 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PRSS3P35030 304 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SFTPDP35247 375 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DCAF7P61962 342 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 KCNJ10P78508 379 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TSC22D1Q15714 1073 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TP53I3Q53FA7 332 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 BEND4Q6ZU67 534 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PRR22Q8IZ63 422 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 P2RY12Q9H244 342 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 STARD5Q9NSY2 213 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM225BP0DP42 221 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GIPRP48546 466 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR5W2Q8NH69 310 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SPTSSAQ969W0 71 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CACNA1CQ13936 2221 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 H0YGG7 62 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PEX11BO96011 259 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF28P17035 718 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HTR3AP46098 478 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CASP6P55212 293 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FGL1Q08830 312 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 COQ8AQ8NI60 647 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 IL37Q9NZH6 218 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CA5AP35218 305 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 BEST3Q8N1M1 668 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF611Q8N823 705 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 INIPQ9NRY2 104 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CBLCQ9ULV8 474 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 VDAC3Q9Y277 283 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 M0R036 132 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJB6O75190 326 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 AIFM1O95831 613 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 C1QAP02745 245 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ALPLP05186 524 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PGGHGQ32M88 737 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR5B2Q96R09 309 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 INTS14Q96SY0 518 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PKMYT1Q99640 499 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ICKQ9UPZ9 632 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SOX3P41225 446 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HOXC5Q00444 222 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 RSU1Q15404 277 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HES5Q5TA89 166 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ARL6Q9H0F7 186 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FAM227AF5H4B4 570 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SULT2B1O00204 365 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 EGFP01133 1207 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms