RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ABATP80404 500 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 SHC2P98077 582 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 DGCR2P98153 550 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 OR10A4Q9H209 315 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 KCNN2Q9H2S1 579 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 FGF22Q9HCT0 170 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 LAMA1P25391 3075 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD1-201ENST00000259365 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM129A0AVI4 362 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 GXYLT2A0PJZ3 443 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 IDSB3KWA1 339 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HCN1O60741 890 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 EFCAB14O75071 495 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 THY1P04216 161 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 HMGN1P05114 100 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RPS5P46782 204 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RGS1Q08116 209 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZMYND11Q15326 602 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR1Q1Q15612 314 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF836Q6ZNA1 936 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR5J2Q8NH18 312 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BPIFA2Q96DR5 249 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa12.46□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CDHR4A6H8M9 788 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C74A6NCV1 312 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ACOD1A6NK06 481 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 F3P13726 295 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CXCL3P19876 107 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 GDI1P31150 447 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BMP8BP34820 402 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 GZMKP49863 264 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ATP12AP54707 1039 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TEKQ02763 1124 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FGL2Q14314 439 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CHMP1BQ7LBR1 199 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 NRROSQ86YC3 692 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM239Q8WW34 195 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DIO2Q92813 273 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF224Q9NZL3 707 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 E9PQ18 207 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FZD7O75084 574 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ALX3O95076 343 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PITPNBP48739 271 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 LIMK1P53667 647 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 BNC1Q01954 994 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 STX4Q12846 297 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf61Q13536 156 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF620Q6ZNG0 422 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PRR23CQ6ZRP0 262 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMIEQ8NEW7 156 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ABHD4Q8TB40 342 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 A8MUA0 341 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CENPBD1B2RD01 187 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DRD3P35462 400 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ARPC4P59998 168 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 WDR88Q6ZMY6 472 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SIAH3Q8IW03 269 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SMPDL3BQ92485 455 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CD93Q9NPY3 652 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MEIS3P1A6NDR6 274 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 POM121CA8CG34 1229 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 MT-ND5P03915 603 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 FBXO45P0C2W1 286 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 EDNRAP25101 427 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 RPE65Q16518 533 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 AADACL4Q5VUY2 407 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD1-201ENST00000259365 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms