RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 LGI1O95970 557 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 EDN3P14138 238 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 CRHBPP24387 322 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 ID2Q02363 134 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 MGAT2Q10469 447 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC6-201ENST00000243108 SYT5O00445 386 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CYP4B1P13584 511 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 IL7RP16871 459 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 FUT4P22083 530 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CBLP22681 906 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CD96P40200 585 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PMP22Q01453 160 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 IL1RL1Q01638 556 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TUBA3CQ13748 450 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 GANABQ14697 944 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MEP1AQ16819 746 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 LACC1Q8IV20 430 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 BCORP1Q8N888 145 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF566Q969W8 418 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 HES7Q9BYE0 225 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 RLIMQ9NVW2 624 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MAT2BQ9NZL9 334 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 A8MUA0 341 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PRAMEF2O60811 474 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CCNB2O95067 398 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SLC35E2P0CK97 266 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MST1P26927 711 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 EPHA2P29317 976 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 GABARAPL2P60520 117 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CHRNEQ04844 493 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CDK5R2Q13319 367 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF773Q6PK81 442 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MDS2Q8NDY4 140 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 HRASLS5Q96KN8 279 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 APOL4Q9BPW4 351 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 FUZQ9BT04 418 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 TEX15Q9BXT5 2789 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 A1L4Q6 167 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ACP2P11117 423 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PARP8Q8N3A8 854 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 NR4A3Q92570 626 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 PIGUQ9H490 435 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 M0R3H8 397 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC159P0C7I6 412 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 NT5EP21589 574 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 MAP3K8P41279 467 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 NUP107P57740 925 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SMIM11AP58511 58 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 IL5RAQ01344 420 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 DUSP5Q16690 384 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 SPINK14Q6IE38 97 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 DEF8Q6ZN54 512 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC6-201ENST00000243108 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms