RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ACVR1BP36896 505 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL1Q96LA6 429 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TSSK3Q96PN8 268 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 REEP4Q9H6H4 257 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf109Q9NX04 203 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TBK1Q9UHD2 729 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPT1Q9Y234 373 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPM1 405 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX19O60806 448 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PROCP04070 461 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX5P09917 674 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 UROSP10746 265 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ADH6P28332 368 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN1P31025 176 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 IDUAP35475 653 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF117Q03924 483 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE7AQ13946 482 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 COX18Q8N8Q8 333 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 BANPQ8N9N5 519 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T11Q8NH01 316 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT7Q99832 543 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 COL6A5A8TX70 2615 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 OIP5O43482 229 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRA3O75311 464 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAP00813 363 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-39P01824 125 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ELK4P28324 431 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PGGHGQ32M88 737 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP157Q5JU67 520 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 JADE3Q92613 823 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC28A1O00337 649 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS7O75251 213 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 THBS1P07996 1170 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB4P48594 390 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB13P59910 316 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA20P61599 178 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 BSPH1Q075Z2 132 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FAPQ12884 760 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLN3Q6UW01 205 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZSR9 355 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRLAQ7L513 359 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO27Q8NI29 283 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B8Q92506 261 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NGBQ9NPG2 151 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGARQ9NQ88 270 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRQ13535 2644 aa22.77■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PP18 115 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DPRXA6NFQ7 191 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF195O14628 629 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS14O43566 566 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DNM1P46Q6ZS02 220 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CDS1Q92903 461 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD2Q9BX70 525 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM2Q9C040 744 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GIN1Q9NXP7 522 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPA7E9PJI5 369 aa22.75■■□□□ 1.23
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