RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 ME2P23368 584 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ELK4P28324 431 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ADH6P28332 368 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 CTBP2P56545 445 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ZNF117Q03924 483 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 KLHL26Q53HC5 615 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 OR56A1Q8NGH5 318 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 AGR3Q8TD06 166 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 KLHL15Q96M94 604 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.35■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF9O43307 516 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 SMPD2O60906 423 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 C6orf47O95873 294 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 THBDP07204 575 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 KRT16P08779 473 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ATP6V1C1P21283 382 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 C21orf58P58505 322 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 VSNL1P62760 191 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 DCST2Q5T1A1 773 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 IL23RQ5VWK5 629 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 HBMQ6B0K9 141 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 C20orf204Q6ZNR8 217 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 BEND4Q6ZU67 534 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 SFXN5Q8TD22 340 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 MOAP1Q96BY2 351 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 C1orf50Q9BV19 199 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 OR10A4Q9H209 315 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.34■□□□□ 0.21
CTIF-206ENST00000588345 NPIPB9F8W1W9 429 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 KLF4O43474 513 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 EFNA2O43921 213 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 OPN1LWP04000 364 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 TUBBP07437 444 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 BPGMP07738 259 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 INHBBP09529 407 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PRPS1L1P21108 318 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 SHC1P29353 583 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 AGTR1P30556 359 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 ETV4P43268 484 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 P2RX1P51575 399 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 ATP12AP54707 1039 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 FOXF1Q12946 379 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 TP53BP2Q13625 1128 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 BEX5Q5H9J7 111 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 Q5PR19 223 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 CBLN3Q6UW01 205 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 LILRA2Q8N149 483 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 ZNF527Q8NB42 609 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 RNF128Q8TEB7 428 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 NUDT8Q8WV74 236 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 OSTF1Q92882 214 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 UBTD1Q9HAC8 227 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 FANCFQ9NPI8 374 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 OIP5O43482 229 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 TYROBPO43914 113 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 NPIPA8P0DM63 369 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 CREB1P16220 341 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 CARD18P57730 90 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 P3H2Q8IVL5 708 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-206ENST00000588345 FBXO27Q8NI29 283 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms