RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 DDA1Q9BW61 102 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SAP130Q9H0E3 1048 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AMBNQ9NP70 447 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ERGIC3Q9Y282 383 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 B4E171 279 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 AP3D1O14617 1153 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ENTPD6O75354 484 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 PTHP01270 115 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NR4A1P22736 598 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN7P41732 249 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NCS1P62166 190 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 AMER2Q8N7J2 671 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN22Q8N7P3 220 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CDRT4Q8N9R6 151 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 KAT2AQ92830 837 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRL4Q96PJ5 515 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 DCSTAMPQ9H295 470 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 UCK1Q9HA47 277 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR70Q9NW82 654 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 HRASLS2Q9NWW9 162 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENONQ9NZV5 590 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5K3A6NET4 321 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 STMND1H3BQB6 276 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR75O95800 540 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNYL3P0C7X3 344 aa23.57■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 STAT5AP42229 794 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LTB4RQ15722 352 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00303Q3SY05 128 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGXQ8TBF5 258 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NKD1Q969G9 470 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SKP1P63208 163 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 PROKR2Q8NFJ6 384 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPBAP1Q96EW2 488 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MGLLQ99685 303 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX12Q9BXU0 123 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRY4Q9C004 299 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF350Q9GZX5 532 aa23.56■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDR45Q9Y484 360 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WUU8 490 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PS29 197 aa23.55■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYR61O00622 381 aa23.55■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 GADD45AP24522 165 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FPR3P25089 353 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB38P57729 211 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 GINS1Q14691 196 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT16Q17RD7 645 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL22Q53GT1 634 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC6Q6NXE6 501 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 NLGN4XQ8N0W4 816 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK1A1LQ8N752 337 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX47Q8TBZ9 253 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 COX4I2Q96KJ9 171 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MND1Q9BWT6 205 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TAPBPLQ9BX59 468 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 EQTNQ9NQ60 294 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MED17Q9NVC6 651 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB7A8K855 629 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 DBTP11182 482 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 VRK2Q86Y07 508 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 EXD3Q8N9H8 876 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A11Q8NCK7 471 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SDK2Q58EX2 2172 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF462Q96JM2 2506 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP5A6NIR3 686 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL15A6NJ78 407 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MU76 341 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1C4O75897 302 aa23.53■■□□□ 1.36
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