RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RAB39B	Q96DA2	213 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF560	Q96MR9	790 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	GPR137	Q96N19	417 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	THAP9	Q9H5L6	903 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	NYAP2	Q9P242	653 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MTOR	P42345	2549 aa		2.58	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SVIL	O95425	2214 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MED13L	Q71F56	2210 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PQ72	361 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CHEK1	O14757	476 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CCL16	O15467	120 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TXNL1	O43396	289 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TSPAN2	O60636	221 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	APBB3	O95704	486 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	IGKV3-15	P01624	115 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HCK	P08631	526 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TNFRSF4	P43489	277 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PITPNB	P48739	271 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TKTL1	P51854	596 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CASP9	P55211	416 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CLDN6	P56747	220 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PON2	Q15165	354 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TRADD	Q15628	312 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RNF212	Q495C1	297 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	GPAT3	Q53EU6	434 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	TMUB2	Q71RG4	321 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RDH11	Q8TC12	318 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MSANTD3	Q96H12	275 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CDHR1	Q96JP9	859 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ABCG4	Q9H172	646 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	NT5DC2	Q9H857	520 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	GINS2	Q9Y248	185 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		2.57	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HIVEP1	P15822	2718 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	THADA	Q6YHU6	1953 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084		A0A1B0GTH9	108 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CCDC69	A6NI79	296 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	REC8	O95072	547 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	VENTX	O95231	258 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SEMA4F	O95754	770 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HP	P00738	406 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MT-ND3	P03897	115 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	FCER2	P06734	321 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CCDC159	P0C7I6	412 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PSMC3	P17980	439 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	SLC11A1	P49279	550 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	CCL11	P51671	97 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	NDST1	P52848	882 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	HAGH	Q16775	308 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	PCK2	Q16822	640 aa		2.56	□□□□□ -2
COX11-208	ENST00000576084	LINC00303	Q3SY05	128 aa		2.56	□□□□□ -2

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