RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMFGO60234 142 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT72Q14CN4 511 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMIPQ8IY22 773 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIPK4Q8NE63 616 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICAM5Q9UMF0 924 aa30.07■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR14I1A6ND48 311 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NID1P14543 1247 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETS2P15036 469 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GZMMP51124 257 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RX1P51575 399 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNEQ86WN2 208 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52P1PQ8NH57 321 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANGPT4Q9Y264 503 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP3M1Q9Y2T2 418 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 RELNP78509 3460 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZIC3O60481 467 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC19A2O60779 497 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGS2P35354 604 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGM1P36871 562 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPA2P48052 419 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGD2Q7Z6J4 655 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALHM3Q86XJ0 350 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZZZ3Q8IYH5 903 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM71CQ8NEG0 241 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAT2Q9GZY6 243 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF835Q9Y2P0 537 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT52Q9Y366 437 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO18BQ8IUG5 2567 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEATR5AQ86XA9 2040 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 OIP5O43482 229 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 THBS1P07996 1170 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABOP16442 354 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SKP2Q13309 424 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFAF6Q330K2 333 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIN52Q52LA3 116 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC30A8Q8IWU4 369 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN24A6NM45 220 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 HK1P19367 917 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCKP35557 465 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARSKQ6UWY0 536 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT73Q86Y46 540 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC15A3Q8IY34 581 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SARAFQ96BY9 339 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIF1Q9H611 641 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRR3Q9UBC9 169 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF232Q9UNY5 417 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WZY1 265 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 VMACQ2NL98 169 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHSL2Q5HYW2 709 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 VRK2Q86Y07 508 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5W2Q8NH69 310 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF583Q96ND8 569 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 VDAC3Q9Y277 283 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC6A5Q9Y345 797 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNHIT1O43257 154 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP7B1O75881 506 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT14O95848 222 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCGF2P35227 344 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF220Q5VTB9 566 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARSGQ96EG1 525 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF607Q96SK3 696 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED17Q9NVC6 651 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMTM6Q9NX76 183 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSGIN2Q9Y236 505 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED12Q93074 2177 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPA2E9PIF3 369 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPA3F8WFD2 350 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCKDKO14874 412 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 WISP1O95388 367 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 STSP08842 583 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MNAT1P51948 309 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFRA1P56159 465 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAURQ03405 335 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBFBQ13951 182 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSWIM7Q19AV6 140 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERICH5Q6P6B1 374 aa30.01■■■□□ 2.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 AAGABQ6PD74 315 aa30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms