RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf109	Q9NX04	203 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TIMM22	Q9Y584	194 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	EML5	Q05BV3	1969 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM221	A6NGB7	291 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139		M0R296	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	GYG2	O15488	501 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ZW10	O43264	779 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	SEC22B	O75396	215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	SEMA3D	O95025	777 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	NPPA	P01160	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PDYN	P01213	254 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT16	P08779	473 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	COX4I1	P13073	169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TDGF1	P13385	188 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	JAK1	P23458	1154 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PIK3R1	P27986	724 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	CMPK1	P30085	196 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ASMT	P46597	345 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	FASLG	P48023	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	REEP5	Q00765	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	IL1RL1	Q01638	556 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RELA	Q04206	551 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	NR1D2	Q14995	579 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATS1	Q496A3	300 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	MIDN	Q504T8	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	NRROS	Q86YC3	692 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	SFRP1	Q8N474	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	OR7G3	Q8NG95	312 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LCN9	Q8WX39	176 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ROPN1L	Q96C74	230 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	C3orf30	Q96M34	536 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	CATSPER2	Q96P56	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4K3	Q96R72	315 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RHBG	Q9H310	441 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	KLHL31	Q9H511	634 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AHSP	Q9NZD4	102 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ARMCX1	Q9P291	453 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	BTRC	Q9Y297	605 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LILRA5	A6NI73	299 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	C2orf74	A8MZ97	194 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	LMO7DN	F2Z398	122 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139		H0YHG0	523 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AQP9	O43315	295 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	PEX11A	O75192	247 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6AP2	O75787	350 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	IL6	P05231	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	CYC1	P08574	325 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	T-ENOL	P0DO92	83 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	GPX3	P22352	226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	AHR	P35869	848 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	HTR6	P50406	440 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	KCNK10	P57789	538 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	C21orf58	P58505	322 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	TUBA4A	P68366	448 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CNOT1-222	ENST00000570139	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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