RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564511.1

TUBGCP4-209, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 4, human

TSL 3

Gene TUBGCP4, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP4-209	ENST00000564511	HSPA7	P48741	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GZMK	P49863	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	XK	P51811	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CLDN20	P56880	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RAB35	Q15286	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TGFBI	Q15582	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PDK4	Q16654	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	HTRA1	Q92743	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DSN1	Q9H410	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RYR3	Q15413	4870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ACOX3	O15254	700 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RAMP1	O60894	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	BANF1	O75531	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LY86	O95711	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TTC4	O95801	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TGFA	P01135	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GBA	P04062	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FCGR2A	P12318	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ITGA2	P17301	1181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	EPOR	P19235	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	IL11	P20809	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	S1PR1	P21453	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DRD5	P21918	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CD40	P25942	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SERPINB1	P30740	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KRT20	P35900	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MAGEA3	P43357	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PPIC	P45877	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C21orf58	P58505	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TAB1	Q15750	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TBCC	Q15814	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TUBGCP4-209	ENST00000564511	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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