RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	SYPL1	Q16563	259 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR5B2	Q96R09	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	RAB33B	Q9H082	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SNX6	Q9UNH7	406 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	WWP2	O00308	870 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR7A17	O14581	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR1F1	O43749	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LALBA	P00709	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	HMGCL	P35914	325 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC26A2	P50443	739 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CHRNB3	Q05901	458 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LAGE3	Q14657	143 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PDK3	Q15120	406 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ARMCX2	Q7L311	632 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PQ72	361 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830		E7ESA3	106 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PHOX2A	O14813	284 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	GMFG	O60234	142 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SEMG1	P04279	462 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	UGT1A3	P35503	534 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	DLST	P36957	453 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	EOGT	Q5NDL2	527 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SERAC1	Q96JX3	654 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	NOL4	O94818	638 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	MBD3	O95983	291 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	RPA2	P15927	270 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SNAP23-208	ENST00000563830	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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