RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2T11	Q8NH01	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PPM1	405 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PQD3	144 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	DPRX	A6NFQ7	191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SCD	O00767	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RIPK2	O43353	540 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAM11	O75078	769 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CRCP	O75575	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ADA	P00813	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HPGD	P15428	266 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	IL32	P24001	234 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ADH6	P28332	368 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	IDUA	P35475	653 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF117	Q03924	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FAP	Q12884	760 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PDE7A	Q13946	482 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	JADE3	Q92613	823 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	REEP4	Q9H6H4	257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf109	Q9NX04	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PP18	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CD5L	O43866	347 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TBX19	O60806	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	RAMP1	O60894	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	CD8A	P01732	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PROC	P04070	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ALOX5	P09917	674 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	UROS	P10746	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	EDNRA	P25101	427 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	ELK4	P28324	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZSR9	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms