RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 PRELID1Q9Y255 219 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 C4orf47A7E2U8 309 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 CARD17Q5XLA6 110 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 ELK4P28324 431 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R46P59540 309 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 OR5B2Q96R09 309 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 SORT1Q99523 831 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 THSD1Q9NS62 852 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 METTL15A6NJ78 407 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF264O43296 627 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 S100A2P29034 98 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R20P59543 309 aa7.97□□□□□ -1.13
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