RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 OR4C3Q8NH37 302 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAM110BQ8TC76 370 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SFXN5Q8TD22 340 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR7D2Q96RA2 312 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SMR3AQ99954 134 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZNF559Q9BR84 538 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 INPP5KQ9BT40 448 aa8.75□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 PIGUQ9H490 435 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MED11Q9P086 117 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 COL6A5A8TX70 2615 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.74□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CCDC154A6NI56 674 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 B4DXG7 233 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 AQP7O14520 342 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 HCN1O60741 890 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CBR3O75828 277 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 HPNP05981 417 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NPIPA8P0DM63 369 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 UQCRC2P22695 453 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CDKN2CP42773 168 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 EMC4Q5J8M3 183 aa8.74□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 MIER2Q8N344 545 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GATSQ8NAP1 163 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 RNF138Q8WVD3 245 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.74□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 PANX1Q96RD7 426 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 STACQ99469 402 aa8.74□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 UBQLN3Q9H347 655 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.74□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 GIN1Q9NXP7 522 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 HCFC1P51610 2035 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 NCKAP5O14513 1909 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR14I1A6ND48 311 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ADAM10O14672 748 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ANGPTL1O95841 491 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 IL6P05231 212 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 KRT16P08779 473 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR12D1P0DN82 309 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 IMPDH2P12268 514 aa8.73□□□□□ -1.01
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CS-217ENST00000550044 TBXA2RP21731 343 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GUCY1A3Q02108 690 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GTF3C1Q12789 2109 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 DCST2Q5T1A1 773 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 WLSQ5T9L3 541 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-217ENST00000550044 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.73□□□□□ -1.01
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