RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545607.5

QKI-217, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-217	ENST00000545607	CCNI	Q14094	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	P2RY6	Q15077	328 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	STK11	Q15831	433 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	NNAT	Q16517	81 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607		E7EQL1	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607		H0YC42	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CYR61	O00622	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	FGF17	O60258	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SUPT3H	O75486	399 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CBR3	O75828	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	AQP8	O94778	261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	GUCA1C	O95843	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	C8G	P07360	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SERPINA6	P08185	405 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	PEPD	P12955	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CD1D	P15813	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TAC1	P20366	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CRHR1	P34998	444 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	MAGEA12	P43365	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	KCNC1	P48547	511 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	PHC1	P78364	1004 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	DLG1	Q12959	904 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ACAP2	Q15057	778 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SGCB	Q16585	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607		Q6ZPA2	131 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
QKI-217	ENST00000545607	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms