RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MND1Q9BWT6 205 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.74■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NPIPA7E9PJI5 369 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 J3QRK9 145 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 AGRPO00253 132 aa18.74■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 KCNK2O95069 426 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NPIPA8P0DM63 369 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PRG2P13727 222 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR4P46093 362 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.74■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 EVA1AQ9H8M9 152 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF21Q9NSA1 209 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 IL20Q9NYY1 176 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 H0YIG0 161 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 GKN3PP0CG01 181 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1Q1Q15612 314 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G2CQ5R387 149 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF31Q96EP0 1072 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 OR51E2Q9H255 320 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 FOLH1BQ9HBA9 442 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC2DQ9UHP7 191 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 SCG5P05408 212 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 HTR2AP28223 471 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 OR1D4P47884 311 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DAB2P98082 770 aa18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 FLYWCH1Q4VC44 716 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PROKR2Q8NFJ6 384 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DGAT2Q96PD7 388 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 AKIP1Q9NQ31 210 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PIP5K1CO60331 668 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB36O95755 333 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD34CP0C6C1 535 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ALAS2P22557 587 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 EMDP50402 254 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 C1DQ13901 141 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 NANOGP1Q8N7R0 232 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 POGLUT1Q8NBL1 392 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LNP1A1A4G5 178 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL12BO14950 172 aa18.71■□□□□ 0.59
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PACSIN3-211ENST00000539589 RFX3P48380 749 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 LIMK1P53667 647 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TMED1Q13445 227 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 DBX2Q6ZNG2 339 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 AMER2Q8N7J2 671 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MCFD2Q8NI22 146 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 OPALINQ96PE5 141 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
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