RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527855.1

CCDC191-208, Transcript of coiled-coil domain containing 191, human

TSL 3

Gene CCDC191, Length 837 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC191-208	ENST00000527855	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855		A8MUI8	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855		G3V2L1	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855		H0YIV9	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SLC28A1	O00337	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MANBA	O00462	879 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	OR7A17	O14581	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	AZIN1	O14977	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	RGS14	O43566	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ALOX12B	O75342	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SEC22B	O75396	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	JRK	O75564	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	BMP10	O95393	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PDYN	P01213	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	KLK1	P06870	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FH	P07954	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	UROS	P10746	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MMP11	P24347	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	RAB38	P57729	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DNAJB13	P59910	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	STX3	Q13277	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CUL3	Q13618	768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	GPR180	Q86V85	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MMP21	Q8N119	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DPP10	Q8N608	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	HTRA1	Q92743	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	HBEGF	Q99075	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	LPAR4	Q99677	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PRORY	Q9H606	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCDC191-208	ENST00000527855	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms